故事描述因為在2014年遭逢交通意外而將大腦取出、再次醒來之後已經是2030年的少年夏目AKIRA，發現自己已經成為名為「EX-ARM“No.00-α”」的兵器。擁有超強能力的他，為了找回失去的記憶而協助警察內部組織EX-ARM對策課展開打擊罪犯的活動。